More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2365 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  51.04 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  49.59 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  49.59 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  46.75 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 245 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  48.33 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  47.35 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 278 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  47.11 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  46.53 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 376 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 274 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 376 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  45.04 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 274 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 274 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 274 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  44.9 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.77 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  43.1 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  40.68 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  31.58 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  33.91 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 308 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  32.59 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.68 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.13 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.52 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.58 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>