More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0722 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  44.73 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  43.88 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  43.88 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  44.35 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  39.67 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.39 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  33.64 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 274 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 332 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 376 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 287 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  27.71 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  27.71 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  27.27 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  27.27 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  26.84 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  27.27 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  27.27 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  27.71 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  27.71 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.45 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.77 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1940  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331294  normal  0.596392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.31 
 
 		 286 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.49 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>