More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0955 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3711  GntR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 234 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  29.27 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 249 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.75 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 267 aa  95.1  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.37 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.69 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  29.66 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  29.66 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 308 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 376 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.36 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 376 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.93 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  30.74 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  31 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>