More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7380 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
251 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  48.16 
 
 
249 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3333  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 
253 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2101  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 
254 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.1 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
249 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
258 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
256 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
256 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
256 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  37.08 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
238 aa  95.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.31 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  29.2 
 
 
241 aa  92.4  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  24.68 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  24.68 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  25.11 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  24.68 
 
 
236 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
266 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 
248 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.75 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.75 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.75 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.75 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.75 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  25.43 
 
 
235 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.75 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.75 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.75 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
241 aa  86.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  25 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
232 aa  85.9  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  29.95 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  29.95 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  34.26 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  29.95 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  24.24 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.14 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2887  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  24.24 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  29.18 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  24.24 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  29.18 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  33.33 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  29.44 
 
 
239 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 
249 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  24.24 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>