More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3711 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3711  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  52.36 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  28.27 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  26.38 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  24.36 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  30.64 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.91 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.62 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  36.57 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  30.08 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  36.57 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.8 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  35.82 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  24.42 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  28.5 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  22.64 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2362  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1023  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.27 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.86 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>