More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2362 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2362  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  533  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1023  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  534  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 285 aa  225  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.35 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.11 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  27.2 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.08 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 232 aa  85.9  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.96 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.08 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  21.07 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0264  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4971  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  23.61 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  24.36 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4999  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4595  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5096  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  24.32 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4736  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  22.75 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  24.32 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  27.54 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4956  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4984  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4576  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  25.23 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>