More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4176 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1023  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  46.04 
 
 		 278 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2362  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.86 
 
 		 243 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  25.82 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 244 aa  95.9  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  24.28 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 239 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  24.12 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 232 aa  90.5  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 241 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3357  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  25.55 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.568535  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 235 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 252 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  26.43 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  24.45 
 
 		 245 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2399  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.720862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  30.53 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.12 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2585  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.21 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.12 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.12 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1176  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.21 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3313  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.21 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.12 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0315  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.21 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3347  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.21 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.546924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 		 246 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.68 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.58 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  23.08 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.06 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 260 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 268 aa  85.9  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.02 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.97 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  22.86 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>