More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1192 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  88.57 
 
 		 247 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  48.1 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2362  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1023  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 290 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 290 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  36.19 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  36.19 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.77 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  36.19 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  35.71 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  35.24 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.38 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.78 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  25.97 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  30.9 
 
 		 579 aa  99.4  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  31.23 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  29.44 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  29.44 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.44 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.44 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.36 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>