More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4409 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  81.22 
 
 		 247 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  78.78 
 
 		 247 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 250 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  41.28 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_007974  Rmet_5470  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0836  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00839653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4699  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4599  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279562  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  31.54 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.82 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2362  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1023  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.1 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  44.94 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  44.94 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  30.54 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  23.21 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  45.45 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  30.6 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  33.09 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  53.03 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  28.88 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  37 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.4 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  40.79 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  44.59 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.69 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0264  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  56.14 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  24.26 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  24.69 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  38.37 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  41.56 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  25.74 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  38.46 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  22.5 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>