More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4179 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  64.56 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  64.56 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0170  GntR family transcriptional regulator  64 
 
 		 200 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0190  GntR family transcriptional regulator  63 
 
 		 200 aa  234  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0181  GntR family transcriptional regulator  63 
 
 		 200 aa  234  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.39 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 270 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  30.63 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  30.63 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  30.63 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  30.63 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.16 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  30.12 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  30.18 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  30.12 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  27.35 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.16 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.36 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  27.76 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.76 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  27.76 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.76 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.44 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  27.69 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  31.14 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4599  Fis family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279562  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  28.22 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>