More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3625 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 274 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  39.67 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4599  Fis family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279562  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5470  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  34.62 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4699  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  33.19 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0836  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00839653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.16 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  24.69 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  24.15 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  27.2 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  26.53 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  30.33 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  25.42 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  23.58 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0721  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.66 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274282  normal  0.4322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  26.12 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  30.17 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.02 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  21.98 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  23.24 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.02 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  22.8 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  27.5 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  26.89 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  27.19 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  26.89 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  26.89 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  27.19 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  24.47 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  24.47 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  24.47 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  23.63 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  26.47 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  24 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  25.65 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  25.51 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  26.38 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>