More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0617 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  97.6 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  38.3 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  37.92 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4699  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  37.04 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 274 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0836  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00839653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4599  Fis family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279562  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 258 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5470  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.99 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  25.91 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.23 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  29.55 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.31 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  29.21 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  24.39 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  26.91 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  26.16 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  28.74 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0126  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000292092  hitchhiker  0.0000000000517397 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  27.27 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  30.12 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  29.15 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.41 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.51 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3004  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000311693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  24.12 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  27.05 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  25.65 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  25.63 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1929  GntR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  25.1 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  25.21 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0099  histidine utilization repressor  25.41 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  26.64 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  41.57 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0093  histidine utilization repressor  25.41 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  47.14 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  26.36 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  47.14 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>