More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0753 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  72.84 
 
 		 243 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  73.55 
 
 		 243 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3004  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000311693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.25 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.71 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.99 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.2 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  28.81 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4685  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4971  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>