More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0791 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  84.47 
 
 		 266 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  42.29 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  42.29 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  41.9 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.97 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 244 aa  99.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.42 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.86 
 
 		 232 aa  92.4  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  25.42 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.63 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 245 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.8 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3791  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  23.17 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  24.9 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.51 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>