More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3563 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  97.51 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  97.51 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  97.51 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  97.51 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  97.51 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  97.51 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  97.51 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  92.95 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  97.93 
 
 		 241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  97.37 
 
 		 228 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  70.54 
 
 		 243 aa  361  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  69.71 
 
 		 243 aa  360  8e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  44.08 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  43.52 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.96 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0844  transcriptional regulator, putative  35.09 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  27.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  26.84 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.13 
 
 		 232 aa  95.1  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.27 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  26.87 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  26.92 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.04 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  26.92 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  29.69 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  25.96 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>