213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0844 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0844  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 237 aa  344  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  69.79 
 
 		 237 aa  344  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  23.95 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  21.37 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  22.51 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  22.37 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.44 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  23.43 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  18.61 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  20 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  21.97 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  23.93 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  22.49 
 
 		 579 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  21.03 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.17 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  23.89 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  31.78 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  21.88 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  23.61 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.28 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  19.64 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  19.64 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  19.64 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9145  transcriptional regulator GntR family  26.41 
 
 		 293 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  19.64 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  22.66 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03974  predicted DNA-binding transcriptional regulator of phosphonate uptake and biodegradation  25.23 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3889  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.23 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  19.64 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4656  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.23 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  22.08 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  21.89 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03934  hypothetical protein  25.23 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3924  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.23 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4568  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  25.23 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  19.64 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  19.74 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  31.78 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  31.01 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  31.01 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  31.01 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5615  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  24.77 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  31.01 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  31.01 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  20.56 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  24.77 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  20.76 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  19.57 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  22.47 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>