More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2778 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0563  putative transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.25 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0844  transcriptional regulator, putative  23.95 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  23.79 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  25.54 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  32.94 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  28.63 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3175  putative transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.43 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  31.49 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>