More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04320 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  100 
 
 
240 aa  486  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  57.56 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
267 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  54.27 
 
 
248 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  54.27 
 
 
248 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  54.27 
 
 
248 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  53.42 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
248 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  53.42 
 
 
248 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  53.42 
 
 
248 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  53.42 
 
 
248 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  55.04 
 
 
244 aa  257  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  52.99 
 
 
248 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  53.59 
 
 
244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  52.32 
 
 
244 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  52.74 
 
 
244 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
244 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
244 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  51.48 
 
 
244 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  51.48 
 
 
244 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  51.48 
 
 
244 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  51.48 
 
 
244 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
244 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  51.05 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  50.63 
 
 
244 aa  229  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  45.34 
 
 
241 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
256 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
264 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
265 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
265 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  44.1 
 
 
250 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  41.2 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
254 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
249 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
251 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 
254 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 
246 aa  154  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 
254 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
249 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.24 
 
 
255 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  33.19 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 
243 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 
257 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
257 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
233 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
249 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
232 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
235 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 
248 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.97 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
255 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 
252 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>