More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0563 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0563  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3175  putative transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  35 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  24.56 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  29.14 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  29.66 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  24.56 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  28.67 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  28.67 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.16 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3004  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000311693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  31.96 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  42.17 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  34.78 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.08 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  29.09 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  23.68 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>