More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0724 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.71 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.21 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.21 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.21 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.21 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.21 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.21 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.2 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  26.51 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  23.97 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  23.97 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  23.46 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  23.08 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.95 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  26.2 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  23.77 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  26.67 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  26.78 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  23.08 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  27.85 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  27.85 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  27.27 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  24.57 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>