More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1883 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
246 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  39.57 
 
 
244 aa  164  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  40.65 
 
 
243 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 
246 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 
243 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
241 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
241 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
241 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 
241 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
241 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
241 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 
241 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
241 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
246 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 
249 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 
248 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
233 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 
248 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
248 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
248 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
249 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 
277 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
239 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  27.39 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
256 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  27.39 
 
 
239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  27.39 
 
 
239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  27.39 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
248 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  27.39 
 
 
239 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.64 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.64 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.64 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.64 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
248 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.64 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.68 
 
 
232 aa  91.7  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.21 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  34.42 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.87 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.22 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  25.33 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
244 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
244 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>