More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5470 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5470  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_008786  Veis_4599  Fis family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279562  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  33.47 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  31.36 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0836  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00839653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4699  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.26 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.36 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  26.25 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  28.33 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  25.59 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  25.59 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  34.72 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  34.72 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  34.72 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  34.72 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  34.72 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  26.14 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  22.92 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.25 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  26.5 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  28.82 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  25.21 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  34.72 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.82 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  34.03 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  23.27 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.27 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 274 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.51 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  25.21 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>