More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4599 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4599  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279562  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  50.83 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  42.39 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 264 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5470  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4699  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  31.8 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  32.1 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0836  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00839653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  24.27 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.43 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  28.69 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  30.56 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  26.05 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  28.69 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  26.47 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0096  histidine utilization repressor  26.64 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  23.21 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  24.77 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0098  histidine utilization repressor  26.64 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0099  histidine utilization repressor  26.64 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0093  histidine utilization repressor  26.64 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 247 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0721  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  25.52 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274282  normal  0.4322 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  42.31 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  24.08 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  24.37 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  25.34 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  19.92 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  24.71 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  19.92 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  24.49 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  22.59 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  22.69 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  23.73 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  25.21 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  25 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.58 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>