More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1903 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  84.47 
 
 
261 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
260 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  47.88 
 
 
260 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
278 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
278 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.97 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
264 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  40.94 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
274 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
270 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 
261 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 
261 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
248 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
258 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
248 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 
243 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 
260 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
257 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
244 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
243 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.17 
 
 
243 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 
239 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
243 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
243 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
243 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
243 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
232 aa  99  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.57 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
225 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.36 
 
 
239 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 
247 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 
249 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  25.21 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
246 aa  90.1  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 
269 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  23.43 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  24.17 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  23.43 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.51 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 
242 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3791  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.45 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2893  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.55 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  28.74 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
268 aa  79  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  23.55 
 
 
245 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.07 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  22.98 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  24.22 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>