More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0220 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  88.28 
 
 		 240 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  64.56 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0190  GntR family transcriptional regulator  75 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0181  GntR family transcriptional regulator  75 
 
 		 200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0170  GntR family transcriptional regulator  74.5 
 
 		 200 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.54 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.45 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.45 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.45 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.45 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.45 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.45 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.45 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  26.7 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  26.7 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  26.24 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  26.7 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  25.79 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.42 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.15 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  39.73 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.6 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0887  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  39.53 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  32.5 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  32.5 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  32.5 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0226  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.71 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>