More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0447 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 240 aa  473  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  88.28 
 
 		 240 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  64.56 
 
 		 243 aa  287  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0181  GntR family transcriptional regulator  75.62 
 
 		 200 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0190  GntR family transcriptional regulator  75.62 
 
 		 200 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0170  GntR family transcriptional regulator  75.12 
 
 		 200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.51 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 270 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  30.12 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  26.85 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  26.85 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  26.85 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  26.24 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.24 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.77 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.24 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  24.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  24.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.32 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.03 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  25.79 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  30.24 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.31 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.11 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  44.12 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  27.16 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  28.04 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>