More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0087 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 241 aa  483  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.49 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.7 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.79 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  27.59 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.35 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  24.58 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 274 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  48.75 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  22.75 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  26.84 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  42.16 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>