More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4032 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  99.59 
 
 
241 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  97.93 
 
 
241 aa  484  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0522  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  81.33 
 
 
242 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03974  predicted DNA-binding transcriptional regulator of phosphonate uptake and biodegradation  73.44 
 
 
241 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3889  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  73.44 
 
 
241 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4656  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  73.44 
 
 
241 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0306  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  72.2 
 
 
241 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275672  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03934  hypothetical protein  73.44 
 
 
241 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4568  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  73.44 
 
 
241 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3924  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  73.44 
 
 
241 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5615  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  73.03 
 
 
241 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  72.61 
 
 
241 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2695  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  74.06 
 
 
239 aa  351  8e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0886  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  68.88 
 
 
238 aa  338  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1307  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  71.55 
 
 
239 aa  330  9e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00330813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  39.38 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  39.38 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 
238 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 
238 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
242 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  33.33 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  42.8 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  43.22 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2887  GntR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
240 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0481832  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2558  transcriptional regulator PhnF  41.82 
 
 
239 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2078  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2250  transcriptional regulator GntR  38.12 
 
 
239 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.412993  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  35.33 
 
 
240 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
251 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 
247 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 
243 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  34.33 
 
 
243 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
248 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
243 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
243 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
243 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
243 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
271 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  31.7 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6369  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.972084  normal  0.74852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.67 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.88 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.03 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2856  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5939  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4125  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.44 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3824  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  32.41 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2178  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0464969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3858  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.95264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.17 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2920  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 
242 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  31.03 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.41 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  30.77 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.45 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.45 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.45 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.45 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.61 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.45 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>