More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1823 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  89.21 
 
 		 241 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  39.83 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  39.41 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 308 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  36.75 
 
 		 277 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  34.32 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.03 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  23.58 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  25.75 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  24.66 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.79 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  26.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.61 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  26.61 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.71 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  24.69 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>