More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0732 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  89.21 
 
 		 241 aa  430  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  38.56 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 308 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  34.18 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  35.56 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 245 aa  141  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.76 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  23.93 
 
 		 266 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  25.33 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  27.9 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 271 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 266 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.47 
 
 		 265 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  27.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.47 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.34 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  25.34 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.89 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>