More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1719 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1719  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4447  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.56 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  42.16 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  42.16 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  32.19 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6080  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0921  regulatory protein GntR HTH  27.37 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.888898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  54.39 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  52.54 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  54.9 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  58.62 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  29.7 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.76 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  48.53 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  47.3 
 
 		 256 aa  62  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  44.59 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  50 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  52.63 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  30.56 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.13 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  33.8 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  52.63 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  45.76 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  50.88 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  43.08 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  40.28 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  48.33 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  50.88 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  48.33 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3198  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.56 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  51.85 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  47.46 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  48.33 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  44.44 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  48.33 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  44.93 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  38.1 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  48.44 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  47.37 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  47.46 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  41.79 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  28.93 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  43.48 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  45 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  54.84 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  49.15 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  40.54 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  43.48 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  30.28 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  40.3 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  43.24 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  57.69 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  38.36 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  40.54 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  38.36 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  43.33 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  44.87 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>