More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3198 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3198  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  502  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  32.2 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.96 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.71 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  28.51 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  31.66 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>