More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1304 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  67.98 
 
 		 232 aa  295  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  56 
 
 		 260 aa  234  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  55.41 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  54.67 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  53.48 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 248 aa  188  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  45.85 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  43.91 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  45.85 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  45.65 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 286 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  31.72 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.74 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 266 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.47 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.9 
 
 		 263 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.24 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  30.3 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.13 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.88 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.88 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  24.88 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.88 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  24.88 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>