More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1316 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  71.98 
 
 		 232 aa  322  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  65.2 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  52.84 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  50 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  52.21 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  50.88 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  45.69 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  41.59 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1287  hypothetical protein  90.32 
 
 		 129 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1304  hypothetical protein  90.32 
 
 		 129 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276446  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 286 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.57 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.56 
 
 		 263 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.27 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 195 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4157  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.3 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  32.41 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  33.93 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  32.41 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.91 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.61 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.13 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  31.55 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.64 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>