More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3104 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
226 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  74.11 
 
 
226 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  48.59 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  44.54 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
221 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  43.48 
 
 
225 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  45.2 
 
 
229 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  46.34 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  46.39 
 
 
223 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.51 
 
 
230 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  44.58 
 
 
233 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  36.89 
 
 
230 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  47.2 
 
 
224 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  41.87 
 
 
222 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  42.6 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  38.43 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  41.81 
 
 
233 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  38.69 
 
 
226 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  37.79 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
226 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
225 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 
225 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
337 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.67 
 
 
225 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  37.98 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
235 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  38.54 
 
 
252 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.17 
 
 
222 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  37.56 
 
 
225 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  36.54 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  36.92 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  37.96 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  37.13 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.33 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  35.9 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
216 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  36.32 
 
 
218 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  39.18 
 
 
227 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  39.41 
 
 
224 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
230 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  35.19 
 
 
225 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  36.27 
 
 
217 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  38.69 
 
 
231 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  38.46 
 
 
222 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  35.16 
 
 
231 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.49 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  32.69 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  33.98 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 
268 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  37.95 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  31.82 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.65 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 
249 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  31.22 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
252 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  31.53 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  30.62 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  31.28 
 
 
231 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.69 
 
 
249 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  31.53 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  31.14 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.15 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.75 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  37.3 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  37.34 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  31.58 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 
253 aa  85.1  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
238 aa  84.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.97 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  31.22 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  36.59 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  29.06 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  30.62 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.41 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.22 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.18 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>