More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2080 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  100 
 
 		 233 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  58.62 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  58.33 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  57.64 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  60.96 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 252 aa  188  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  39.15 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.47 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.79 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.79 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.79 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  34.09 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  33.74 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.79 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.75 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.74 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.45 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.21 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.74 
 
 		 258 aa  92  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  37.74 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  37.74 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.74 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.74 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.74 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  37.74 
 
 		 258 aa  91.7  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.23 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  35 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  36.04 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.89 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.92 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  33.81 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  37.55 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  32.77 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.21 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.03 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  29.63 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  33.2 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.37 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  38.1 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.34 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.88 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.22 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.18 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.89 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.05 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  36.23 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.43 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  36.32 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  34.62 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.65 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  34.82 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  30.68 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.07 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.65 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  33.78 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  29.74 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.9 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.46 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.64 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  34.12 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.64 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.34 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.34 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  34.03 
 
 		 285 aa  78.2  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.07 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>