More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1761 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  71.79 
 
 
254 aa  307  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  53.56 
 
 
242 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  53.68 
 
 
282 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  52.97 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  52.97 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  52.97 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  56.47 
 
 
233 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
252 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  52.16 
 
 
251 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 
248 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  37.66 
 
 
243 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  40.09 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  33.88 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.99 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  30.56 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  30.56 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.56 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.56 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.41 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.56 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.56 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.56 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.38 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.9 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.9 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.43 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.9 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  33.93 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  34.52 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.69 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  34.23 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.36 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  36.97 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.62 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  35.47 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.75 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  27.98 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  33.2 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  34.18 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  33.85 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.04 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  35.15 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  31.76 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.86 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  29.41 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.41 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  29.41 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  29.41 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.41 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.41 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.41 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.41 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.51 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  30.64 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6169  regulatory protein GntR HTH  38.07 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  36.71 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.83 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.96 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  33.99 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.7 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.93 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.8 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  30.38 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.44 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  30.09 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  33.33 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.44 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.95 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.7 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  29.52 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3296  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.98008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>