More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2925 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  62.34 
 
 
260 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
249 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.57 
 
 
240 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
240 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5939  transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2178  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
252 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0464969 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2920  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
245 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2585  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  36.8 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2399  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.720862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0315  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  36.8 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
251 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3347  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  36.8 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.546924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3357  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  36.8 
 
 
272 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.568535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1176  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  36.8 
 
 
251 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
252 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3313  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  36.8 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3858  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.95264 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  40.6 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  38.6 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
252 aa  145  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2856  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0266  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  34.91 
 
 
245 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4236  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
243 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4125  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.05 
 
 
245 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4439  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.33 
 
 
245 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
242 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
242 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  30.6 
 
 
253 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
253 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3824  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
238 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
238 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.9 
 
 
244 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  30.9 
 
 
244 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.61 
 
 
243 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2695  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  35.44 
 
 
239 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1307  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.9 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00330813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.19 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03974  predicted DNA-binding transcriptional regulator of phosphonate uptake and biodegradation  33.19 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3889  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.19 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  34.7 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.88 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03934  hypothetical protein  33.19 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4656  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.19 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4568  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.19 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3924  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.19 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5615  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.19 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0886  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  31.09 
 
 
238 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  32.65 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0306  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  31.74 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275672  normal  0.118863 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.04 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0522  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  31.49 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.94 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2250  transcriptional regulator GntR  32.74 
 
 
239 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.412993  normal  0.738616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.32 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.32 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  33.33 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.94 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.32 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.32 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.32 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.32 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0721  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  35.77 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274282  normal  0.4322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  29.52 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.46 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 
249 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>