More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4086 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  78.85 
 
 		 236 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.65 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.9 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  33.81 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  38.28 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.66 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  33 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 250 aa  94.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.69 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  29.95 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>