More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2517 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  58.18 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 282 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  36.71 
 
 		 222 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 244 aa  121  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  35.45 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  33.98 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  32.85 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.86 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28.82 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.78 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.25 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5742  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  33.55 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>