More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3134 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  57.01 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 231 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  48.61 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  55.49 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  43.19 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  35.91 
 
 		 258 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  32.38 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.27 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  27.55 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  30.56 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  26.98 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.62 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  25.37 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  40.21 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44690  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0330789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3807  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>