More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5471 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  98.64 
 
 
220 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 
244 aa  272  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  62.33 
 
 
217 aa  268  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  59.53 
 
 
221 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 
235 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 
273 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
282 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  28 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
262 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
253 aa  61.6  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  25.87 
 
 
226 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.81 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  24.48 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  24.48 
 
 
229 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
251 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
221 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
264 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  36.67 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  37.5 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  35.56 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2015  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  33.71 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.29 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>