More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2514 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  57.99 
 
 		 235 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 282 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  34.67 
 
 		 222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  32.28 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  34 
 
 		 221 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 229 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  35.66 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.37 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.68 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30.72 
 
 		 222 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.18 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.99 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.57 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>