More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4602 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4777  hypothetical protein  74.34 
 
 		 130 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  36.06 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  32.92 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.37 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  37.01 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  41.12 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  38.54 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.75 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>