More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4088 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 236 aa  476  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  78.85 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.68 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.43 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  33.97 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  31.53 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.56 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  44.25 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  32.93 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.12 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 263 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>