More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1925 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  98.65 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  86.36 
 
 		 222 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  66.97 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  63.47 
 
 		 226 aa  280  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 230 aa  277  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  59.31 
 
 		 222 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  34.78 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 267 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.13 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 251 aa  95.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  28.28 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 223 aa  88.2  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  34.43 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  27.78 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3337  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0218222  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>