More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0156 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  77.73 
 
 		 243 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  59.91 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  40.18 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  41.95 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  38.24 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  32.51 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.49 
 
 		 220 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  32.08 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.92 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.46 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.46 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.46 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.46 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.51 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  31.25 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.59 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  33.33 
 
 		 226 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.05 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  33.12 
 
 		 214 aa  89  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.34 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.88 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  26.64 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28.57 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>