More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5875 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 253 aa  223  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 242 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 265 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 235 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 262 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  34.38 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  31.69 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 258 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  33.01 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.17 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3921  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>