More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2023 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 
263 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
245 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
235 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
223 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
223 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
223 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
223 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 
223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 
227 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
219 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
214 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
217 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
223 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
231 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  38.55 
 
 
226 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 
232 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  32.16 
 
 
224 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
224 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
236 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.58 
 
 
239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
229 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  32.87 
 
 
227 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 
221 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.16 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
222 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
222 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
230 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
231 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
238 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
222 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.48 
 
 
224 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 
227 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  30.5 
 
 
218 aa  92  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
230 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 
277 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 
231 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 
222 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
223 aa  89.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
213 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 
233 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
232 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.19 
 
 
229 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
233 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
222 aa  88.6  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
213 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 
221 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
233 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
229 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  32.84 
 
 
240 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  32.84 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
232 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
209 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
229 aa  86.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  33.49 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.78 
 
 
224 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>