More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4297 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  38.64 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  34.29 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  33.02 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  33.8 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.03 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 222 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  28.57 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  34.01 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.51 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  26.5 
 
 		 219 aa  89.7  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>